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統計功能
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Linear regression and correlation
Descriptive statistics
Column statistics
Frequency distribution
Compare two groups
Mann-Whitney test
Categorical outcomes
Unpaired t test from averaged data
Unpaired t test from raw data
Wilcoxon matched pairs test
Compare three or more groups
One-way ANOVA
Repeated measures one-way ANOVA
Two-way ANOVA
Two-way ANOVA. Repeated measures
Contingency table analysis
Kruskal-Wallis test
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Survival analysis
Diagnostic lab tests
ROC curve
Bland-Altman plot
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實際應用範例及其相關連結:
4.氣相層析質譜儀在metandienone的判定—個案報告
存活分析之操作步驟範例假設想探討某藥物對SARS的免疫效果有Treated和Control 兩組 1代表發病,0表示沒發病,第一行的數字是小時 Treated 1484.0000 1.0000 195.0000 1.0000 1236.0000 1.0000 1257.0000 0.0000 703.0000 0.0000 Control 733.0000 0.0000 1164.0000 0.0000 980.0000 0.0000 824.0000 1.0000 792.0000 1.0000 放入Prism後 P value=0.6195 表示藥物對SARS的免疫效果不顯著!
graphpad之相關研究及應用
樂觀的性別差異—雅虎奇摩財經新聞民調的證據
利用多元回歸模型預測鐵礦石價格
應用監督式學習之AdaBoost系統自動化切割脈絡膜新生血管
電腦輔助診斷及量化脈絡膜新生血管 應用於螢光眼底攝影
電腦輔助診斷及量化脈絡膜新生血管 應用於螢光眼底攝影
Basel II下應用商業智慧技術於個人信貸信用評等模型之建置
抑制細胞色素P450 3A4表面電漿共振生物晶片應用於藥物篩選之研發
發展類別最佳化之高解析度之配體受體交互作用評分函數
D型肝炎病毒抗原與核酸分子交互作用之研究
本軟體應用參考範例:
劉晏孜（2021）。天然化合物誘導頭頸癌細胞產生細胞凋亡之機制探討。中山醫學大學醫學研究所博士論文，台中市。 取自https://hdl.handle.net/11296/zszr6r
蔡建隆（2021）。利用次世代定序技術在大腦惡性神經膠質瘤中IDH1和IDH2基因突變狀態和臨床存活率相關性探討。義守大學生物科技學系碩士論文，高雄市。 取自https://ndltd.ncl.edu.tw/cgi-bin/gs32/gsweb.cgi?o=dnclcdr&s=id=%22109ISU05111005%22.&searchmode=basic
周玟瑀（2021）。探討血紅素結合蛋白於慢性阻塞性肺病的角色。臺北醫學大學呼吸治療學系碩士班碩士論文，台北市。 取自https://hdl.handle.net/11296/uv5q4r
蘇麥克（2021）。利用行為組學進行抗憂鬱藥物對斑馬魚運動活力的評價。中原大學生物科技研究所碩士論文，桃園縣。 取自https://hdl.handle.net/11296/6zhh3x
涂廣源（2021）。利用 RNA-Sequencing 探討 Nucleobindin-2 在肝癌細胞中影響基因表現的情形。嘉南藥理大學藥學系碩士論文，台南市。 取自https://hdl.handle.net/11296/22jpa4
巴巴洛（2020）。以結構為基礎探討DNA嵌入劑辨識核酸錯誤鹼基配對及在癌症治療的應用。國立中興大學醫學生物科技博士學位學程博士論文，台中市。 取自https://hdl.handle.net/11296/7rk4kr
吉羅霓（2020）。利用總體基因體學比較台灣茄科細菌性萎凋病抑病土與導病土之微生物相。國立中興大學生物科技學研究所博士論文，台中市。 取自https://hdl.handle.net/11296/zs9zgj
姜晴文（2019）。法律資料分析的優化與應用：以離婚後未成年子女親權酌定的裁判為素材。國立臺灣大學法律學研究所碩士論文，台北市。 取自https://hdl.handle.net/11296/j78g78
蘇里達（2020）。巨峰葡萄（Vitis labruscana）之外皮與種子的體外抗氧化成分分析、數學模式建立及功能性食品之應用。國立屏東科技大學熱帶農業暨國際合作系博士論文，屏東縣。 取自https://hdl.handle.net/11296/rb67zt
許家福（2020）。豬生殖與呼吸綜合症病毒活毒減毒疫苗搭配不同佐劑之效力評估。國立屏東科技大學獸醫學系所碩士論文，屏東縣。 取自https://hdl.handle.net/11296/ymy48g
曹秀萍（2020）。探討Nucleobindin-2對人類肝癌細胞的影響。嘉南藥理大學生物科技系碩士論文，台南市。 取自https://hdl.handle.net/11296/k65y57
洪光明（2020）。設計及合成咪唑衍生物作為新穎UVA阻隔劑。東海大學化學系碩士論文，台中市。 取自https://hdl.handle.net/11296/9xxu67
林伯昱（2019）。功能性抗生物沾黏單層膜於冠狀動脈心血管疾病標誌物之檢測應用。國立中央大學生物醫學工程研究所碩士論文，桃園縣。 取自https://hdl.handle.net/11296/67844m
施尹甯（2019）。納布芬代謝之反應表型鑑定及其臨床應用。國防醫學院藥學研究所碩士論文，台北市。 取自https://hdl.handle.net/11296/9azt2r
李昀霈（2018）。柑橘黃單胞菌Xanthomonas axonopodis效應蛋白XopAI晶體結構與螢光光譜分析。國立中興大學基因體暨生物資訊學研究所碩士論文，台中市。 取自https://hdl.handle.net/11296/sczsn8
謝佳勳（2018）。基於激發光譜掃描之漫反射超光譜系統。國立中央大學光電科學與工程學系碩士論文，桃園縣。 取自https://hdl.handle.net/11296/mwhu25
張慧敏（2017）。探討 Nucleobindin-2過量表現對肝癌細胞的影響。嘉南藥理大學生物科技系碩士論文，台南市。 取自https://hdl.handle.net/11296/emed48
姚怡君（2017）。以農業廢棄物浸液抑制小球藻增生之效益研究。國立臺灣大學生物環境系統工程學研究所碩士論文，台北市。 取自https://hdl.handle.net/11296/p7uq4p
蘇潘（2017）。利用多期Landsat影像軌跡為基礎探討環境干擾之回復力指標。國立中興大學水土保持學系所博士論文，台中市。 取自https://hdl.handle.net/11296/vhyhn7
莫爾東（2016）。檢測高等教育機構對實施知識管理系統的準備度：以貝里斯大學為例。國立臺灣師範大學教育政策與行政研究所博士論文，台北市。 取自https://hdl.handle.net/11296/t3qn38
施博閔（2014）。小角度X光散射在多結構域蛋白Trigger Factor與結蛋白上的應用。國立清華大學生物資訊與結構生物研究所碩士論文，新竹市。 取自https://hdl.handle.net/11296/p59a24
翁伯瑋（2014）。橙黃壺菌L-BL10 品系之基因轉殖平台建立。國立成功大學生物科技研究所碩士論文，台南市。 取自https://hdl.handle.net/11296/2aq4nm
廖偉辰（2014）。建構在以L-System為基礎的植物模型上的階層式限制容積架構。國立暨南國際大學資訊工程學系碩士論文，南投縣。 取自https://hdl.handle.net/11296/5vw3xr
戴德中（2013）。酵素型生物燃料電池陽極電極開發之研究。元智大學化學工程與材料科學學系博士論文，桃園縣。 取自https://hdl.handle.net/11296/bcakz3
阮氏紅幸（2013）。影響線上社群網絡廣告效應的相關要素研究。元智大學管理學院博士班博士論文，桃園縣。 取自https://hdl.handle.net/11296/6r59rb
朱佑祥（2012）。飲水過後所造成的滲透壓力反應對於紅血球細胞膜上水 通道蛋白1 的酪胺酸磷酸化程度與其調節。國防醫學院航太醫學研究所碩士論文，台北市。 取自https://hdl.handle.net/11296/dq96
何碧娜（2012）。Investigating Relationships Among Intra-team trust,Reward systems and Knowledge Sharing Behavior in Indian Industries。國立清華大學國際專業管理碩士班碩士論文，新竹市。 取自https://hdl.handle.net/11296/8vmb25
陳發泉（2011）。氧氣培養箱之設計與氧氣濃度對線蟲壽命的影響。國立臺南大學機電系統工程研究所碩士班碩士論文，台南市。 取自https://hdl.handle.net/11296/ekzef2
張玲玲（2009）。樂觀的性別差異—雅虎奇摩財經新聞民調的證據。國立交通大學管理科學系所博士論文，新竹市。 取自https://hdl.handle.net/11296/d97vdp
柏洛賓（2010）。利用多元回歸模型預測鐵礦石價格。國立臺灣大學企業管理碩士專班碩士論文，台北市。 取自https://hdl.handle.net/11296/44jk64
研究方法及材料：本研究使用毛蘭素與薑花素D分別作用於人類鼻咽癌細胞株與口腔癌細胞株，並進一步分析其分子生物機制。進行細胞毒性試驗、細胞週期分析，利用DAPI染色法進行凋亡細胞之定量，也進行Annexin細胞染色法、粒線體膜電位分析，並利用西方墨點法測定蛋白質表現。研究使用GraphPad Prism Software Version 5.0 (GraphPad Software Inc., La Jolla, CA)，所有實驗至少重複3次，以ANOVA與Student’s t test用於組別間之比較，P值＜0.05被認為具統計學上顯著意義。
經由使用商業的primers試劑擴大IDH1，IDH2基因。委託外生技公司將成對的獨特的adapter-ligated加載到具有配對的150 bp測序讀數的MiSeq測序儀（Illumina，USA）定序。根據病患個別年紀分組，存活時間（日），IDH1和IDH2突變狀態，MGMT甲基化狀態，進行比較分析。使用GraphPad Prism統計軟體使用log-rank檢驗來評估分層生存組之間差異的顯著性。
使用西方墨點法（Western blot）分析小鼠肺部裂解液和支氣管肺泡灌洗液（Bronchoalveolar lavage fluid, BALF）中Hp及iNOS的表現。細胞實驗則是使用THP-1細胞，使用Hp-Hb complex刺激後分析iNOS、精氨酸酶（Arginase-1, Arg-1）、細胞路徑。圖表使用GraphPad Prism version. 8.0製作
劉晏孜（2021）。天然化合物誘導頭頸癌細胞產生細胞凋亡之機制探討。﹝博士論文。中山醫學大學﹞臺灣博碩士論文知識加值系統。 https://hdl.handle.net/11296/zszr6r。
蔡建隆（2021）。利用次世代定序技術在大腦惡性神經膠質瘤中IDH1和IDH2基因突變狀態和臨床存活率相關性探討。﹝碩士論文。義守大學﹞臺灣博碩士論文知識加值系統。 https://hdl.handle.net/11296/m9yu64。
周玟瑀（2021）。探討血紅素結合蛋白於慢性阻塞性肺病的角色。﹝碩士論文。臺北醫學大學﹞臺灣博碩士論文知識加值系統。 https://hdl.handle.net/11296/uv5q4r。
許家福（2020）。豬生殖與呼吸綜合症病毒活毒減毒疫苗搭配不同佐劑之效力評估。﹝碩士論文。國立屏東科技大學﹞臺灣博碩士論文知識加值系統。 https://hdl.handle.net/11296/ymy48g。
施尹甯（2019）。納布芬代謝之反應表型鑑定及其臨床應用。﹝碩士論文。國防醫學院﹞臺灣博碩士論文知識加值系統。 https://hdl.handle.net/11296/9azt2r。
李昀霈（2018）。柑橘黃單胞菌Xanthomonas axonopodis效應蛋白XopAI晶體結構與螢光光譜分析。﹝碩士論文。國立中興大學﹞臺灣博碩士論文知識加值系統。 https://hdl.handle.net/11296/sczsn8。
姚怡君（2017）。以農業廢棄物浸液抑制小球藻增生之效益研究。﹝碩士論文。國立臺灣大學﹞臺灣博碩士論文知識加值系統。 https://hdl.handle.net/11296/p7uq4p。
朱佑祥（2012）。飲水過後所造成的滲透壓力反應對於紅血球細胞膜上水 通道蛋白1 的酪胺酸磷酸化程度與其調節。﹝碩士論文。國防醫學院﹞臺灣博碩士論文知識加值系統。 https://hdl.handle.net/11296/dq96ry。
呂佳璘（2009）。飲水對年輕成人在傾斜床測試時對心率變異及血壓變異的影響。﹝碩士論文。國防醫學院﹞臺灣博碩士論文知識加值系統。 https://hdl.handle.net/11296/zpz46c。
劉晏孜（2021）。天然化合物誘導頭頸癌細胞產生細胞凋亡之機制探討。﹝博士論文。中山醫學大學﹞臺灣博碩士論文知識加值系統。 https://hdl.handle.net/11296/zszr6r。
研究目的：根據統計資料，頭頸癌在全球與臺灣皆位於前十大癌症之列，好發於50-60歲之中壯年男性，除了影響個人健康，也會影響家庭經濟，甚而造成整體社會之疾病負擔。頭頸癌中以口腔癌最為常見，且其標準化發生率呈現逐年上升之趨勢；而鼻咽癌則是具有特殊之地理分布，好發於包含臺灣的東南亞與東亞一帶。因此本研究旨在尋找有潛力且低細胞毒性之天然化合物，探討其在對抗頭頸癌，特別是口腔癌與鼻咽癌方面之作用。
研究方法及材料：本研究使用毛蘭素與薑花素D分別作用於人類鼻咽癌細胞株與口腔癌細胞株，並進一步分析其分子生物機制。進行細胞毒性試驗、細胞週期分析，利用DAPI染色法進行凋亡細胞之定量，也進行Annexin細胞染色法、粒線體膜電位分析，並利用西方墨點法測定蛋白質表現。研究使用GraphPad Prism Software Version 5.0 (GraphPad Software Inc., La Jolla, CA)，所有實驗至少重複3次，以ANOVA與Student’s t test用於組別間之比較，P值＜0.05被認為具統計學上顯著意義。
研究結果：研究結果顯示，毛蘭素具活化人類鼻咽癌NPC-NPC-039和NPC-BM細胞株凋亡與抑制細胞週期的作用，透過粒線體膜電位改變與死亡受體作用途徑，以毛蘭素處理過的鼻咽癌細胞中磷酸化ERK1 / 2呈劑量關係性減少，在ERK1 / 2抑制劑實驗中也可見相對應之結果，推測其為促進細胞凋亡的分子路徑；另一方面，薑花素D在人類口腔癌細胞株也具促進細胞凋亡之效果，實驗顯示其作用為透過JNK1 / 2之分子訊號途徑。
結論與建議：本研究顯示，天然化合物毛蘭素與薑花素D分別在頭頸癌中的鼻咽癌與口腔癌細胞株具促進細胞凋亡之作用，屬於具發展潛力的天然抗癌製劑，未來有待進一步實驗確認其在動物與人體之成效。
蔡建隆（2021）。利用次世代定序技術在大腦惡性神經膠質瘤中IDH1和IDH2基因突變狀態和臨床存活率相關性探討。﹝碩士論文。義守大學﹞臺灣博碩士論文知識加值系統。 https://hdl.handle.net/11296/m9yu64。
大腦神經膠質瘤（Glioblastoma）是惡性腫瘤。經手術，放射線和化學治療，平均存活時間小於一年。IDH1和IDH2是控制細胞內NADP + 異檸檬酸脫氫酶有關的基因。本研究收集39例神經膠質瘤病患的腫瘤樣本。這些病患者都接受過開顱腫瘤切除手術，並且2012年至2018年在高雄義大醫院神經外科進行治療和追蹤。病患臨床資料，包括性別，年齡，病理診斷和追蹤時間，從義大醫院癌症登記資料庫取得。神經膠質瘤樣本的MGMT(O6-methylguanine-DNA methyltransferase)甲基化狀態由病患個案腫瘤病理診斷報告中取得。腫瘤的基因組（genomic）DNA從福馬林固定石蠟包埋（FFPE）病理切片組織中分離出來。經由使用商業的primers試劑擴大IDH1，IDH2基因。委託外生技公司將成對的獨特的adapter-ligated加載到具有配對的150 bp測序讀數的MiSeq測序儀（Illumina，USA）定序。根據病患個別年紀分組，存活時間（日），IDH1和IDH2突變狀態，MGMT甲基化狀態，進行比較分析。使用GraphPad Prism統計軟體使用log-rank檢驗來評估分層生存組之間差異的顯著性。
周玟瑀（2021）。探討血紅素結合蛋白於慢性阻塞性肺病的角色。﹝碩士論文。臺北醫學大學﹞臺灣博碩士論文知識加值系統。 https://hdl.handle.net/11296/uv5q4r。
背景：慢性阻塞性肺部疾病（Chronic Obstructive Pulmonary Disease, COPD）為慢性發炎反應所導致的呼吸道氣流阻塞疾病，病理分型主要分為支氣管炎（Bronchitis）和肺氣腫（Emphysema）。COPD的風險因子除了常見吸菸、空污，反覆的肺部感染也有可能導致COPD發生。COPD常見症狀為喘、痰液變多、胸悶，進而使日常生活品質下降，治療此疾病的醫療花費十分可觀，也對病人的身心靈有極大影響。COPD不單單是肺部疾病，體內的發炎介質和急性蛋白釋放會影響其他器官功能，導致更複雜的疾病發生。血紅素結合蛋白（Haptoglobin, Hp）為急性蛋白的一種，受IL-6的正向調控。Hp由肝臟分泌，其他像是單核球（Monocyte）、巨噬細胞（Mcrophage）、第二型肺泡上皮細胞（Alveolar epithelial cell type 2, AEC II）亦會分泌Hp。在脾臟和肝臟中，Hp主要透過與衰老或過多的血紅蛋白（Hemoglobin, Hb）結合並經由巨噬細胞結合來代謝血紅素（Heme）和再利用鐵（Iron），從而參與紅血球（Red blood cells）的代謝。近年來有研究指出COPD病人血清中Hp濃度比正常人高，且Hp分型也影響著COPD的嚴重度。然而，Hp 在調節 COPD 中的免疫致病作用尚不清楚。因此在本研究中，我們旨在探究Hp在COPD中的角色。
研究材料與方法：本研究收案於台灣北部某家準醫學中心，收案對象為須經手術治療的肺癌患者。從中隨機挑出非合併COPD病史及合併COPD各七位。採集受試者手術切除之肺部組織，並且避開腫瘤的部分，將組織進行免疫組織化學染色法分析Hp的分布表現。另外，抽取COPD病人周邊血液，分離出人體周邊血單核細胞（Peripheral blood mononuclear cell, PBMC）以Reducing SDS-PAGE膠體電泳分析Hp的表現。肺氣腫動物模式部分，以豬胰蛋白酶（Porcine pancreatic elastase, PPE）多次由氣管給予七週大C57BL/6公鼠，於數周後使用蘇木精-伊紅染色（Hematoxylin and eosin, H&E）分析小鼠肺部病理組織染色，以及使用免疫組織染色（Immunohistochemistry, IHC）分析促發炎之誘導型一氧化氮合酶（Inducible nitric oxide synthase, iNOS）和Hp。使用西方墨點法（Western blot）分析小鼠肺部裂解液和支氣管肺泡灌洗液（Bronchoalveolar lavage fluid, BALF）中Hp及iNOS的表現。細胞實驗則是使用THP-1細胞，使用Hp-Hb complex刺激後分析iNOS、精氨酸酶（Arginase-1, Arg-1）、細胞路徑。圖表使用GraphPad Prism version. 8.0製作，數據資料使用IBM SPSS version. 19.0分析。病人資料描述性統計使用student’s t test檢定，以百分比、平均值與標準差（Mean ± SD）呈現，P < 0.05代表有統計上差異，LDH則採用one-way ANOVA分析。
研究結果：COPD病人肺部切片進行免疫組織染色顯示，Hp在肺泡壁（Alveolar wall）以及支氣管上皮細胞（Bronchiolar epithelial cell）呈現高表現。由COPD病人的PBMC中顯示，Hp在26 Kd至43 Kd有些微增加的變化。此外，透過H&E分析顯示，經由PPE刺激的小鼠出現肺氣腫伴隨肺泡擴大和肺部結構破壞的現象。使用 IHC 和西方墨點法檢測也發現 PPE小鼠的肺組織中的Hp和iNOS表現增加。由細胞實驗發現，外加純化的Hp-Hb complex會誘導THP-1細胞中iNOS和AKT活化的表現。
結論：在本研究中，我們證明了肺部Hp潛在調控COPD和 PPE 小鼠肺氣腫的疾病發展，並可能與 AKT 激活有關。迄今為止，Hp 被證明是 COPD 發病機制中潛在的正調節劑，然而Hp 參與疾病進展的機制仍需要進一步研究。
關鍵字：慢性阻塞性肺部疾病、血紅素結合蛋白、人類單核球細胞株
許家福（2020）。豬生殖與呼吸綜合症病毒活毒減毒疫苗搭配不同佐劑之效力評估。﹝碩士論文。國立屏東科技大學﹞臺灣博碩士論文知識加值系統。 https://hdl.handle.net/11296/ymy48g。
豬生殖與呼吸綜合症病毒 (porcine reproductive and respiratory syndrome virus, PRRSV) 可引起保育豬隻呼吸道疾病及母豬繁殖障礙。使用PRRSV疫苗雖可減少PRRSV病毒血症及排毒能力，但引發較為緩慢之特異性體液性免疫及細胞性免疫反應，並對異源性PRRSV感染僅提供部分保護力。因此，本實驗研究目的為探討佐劑與商業化PRRSV疫苗混合使用後之免疫反應，期望可以提早誘發免疫保護力。首先，將測試佐劑是否對肺泡巨噬細胞及PRRSV商業化疫苗造成不良影響。而後，將選用25隻無特定病原 (specific pathogen free, SPF) 豬隻，逢機分成5組 (分別為PBS、Vaccine、CpG ODN、IL-1 β及IL-1 β mutant)，豬隻5週齡進行疫苗免疫，9週齡以野外分離之PRRSV鼻腔接種方式進行攻毒 (106 TCID50/mL)，並於5、7、9、10、11及13週齡進行採血，13週齡進行人道犧牲。試驗期間每日皆進行體溫量測。採集之血液樣本進行PRRSV特異性抗體、PRRSV病毒量、PRRSV特異性分泌IFN-γ細胞及細胞增殖試驗等。犧牲豬隻之肺臟將進行肉眼及顯微評分。最後再以統計軟體 (GraphPad Prism) 分析以上數據，並以ANOVA、Kruskal-Wallis及Log-rank作分析。結果顯示，CpG ODN原始試驗濃度對肺泡巨噬細胞及PRRSV感染皆無不良影響。IL-1 β及IL-1 β mutant須個別稀釋16及32倍才無對肺泡巨噬細胞產生細胞毒性現象，但對於PRRSV感染無或是部份產生不良影響。所有豬隻實驗前皆未產生病毒血症，而免疫及攻毒後可見豬隻產生高量之病毒血症 (Viral load 2.1×101至4.5×103 copies/µL及106至3.3×107 copies/µL之間)。體溫方面，除 PBS之外，所有組別免疫後5天皆有豬隻出現1天之高體溫狀態 (>40℃)；攻毒後，三種佐劑組別皆比疫苗組及PBS組別有較晚及較短之高體溫症狀。Vaccine、CpG ODN、IL-1 β及IL-1 β mutant組別分別於攻毒後14日內各有1、1、1及2頭豬隻死亡，經特殊染色後可見死亡豬隻組織中存在大量PRRSV核酸，可見PRRSV與本次實驗豬隻死亡具高度相關。攻毒後，所有組別豬隻7日內皆出現病毒血症 (106至3.3×107 copies/µL之間) 並持續到28天，且各組別僅攻毒後14天出現顯著差異 (PBS組別高於IL-1 β mutant組別)。疫苗免疫組PRRSV特異性抗體免疫後14天即出現陽轉 (S/P ratio>0.4)，並於攻毒後28天持續上升。肉眼及顯微病變評分、 IFN-γ SCs response及PBMCs 增殖試驗各組間皆無顯著差異。綜觀以上所述，本次使用之三種佐劑皆無或是部分對於肺泡巨噬細胞存活及PRRSV感染產生不良影響，但與PRRSV疫苗混合使用後，對豬隻面臨野外病毒感染時之免疫保護力，與控制組相比並無顯著影響。
施尹甯（2019）。納布芬代謝之反應表型鑑定及其臨床應用。﹝碩士論文。國防醫學院﹞臺灣博碩士論文知識加值系統。 https://hdl.handle.net/11296/9azt2r。
納布芬是一種半合成的鴉片類麻醉止痛劑，止痛效力與嗎啡相當，在臨床上多以注射劑型用於緩解中度至重度疼痛。與一般鴉片類止痛劑不同，納布芬同時在kappa－鴉片類受體產生致效作用以及在mu－鴉片類受體產生拮抗作用，因此幾乎不會引發呼吸抑制、成癮等嚴重副作用，特別的是，此藥會隨劑量提升而產生極值效應(或稱天花板效應)，這使其副作用的發生率極低，更適合臨床上使用，未來或有機會成為嗎啡在臨床上的替代用藥。截至目前為止，有關納布芬在人體內的代謝路徑及酵素間的代謝比例仍無詳細的文獻報導，本研究即以反應表型鑑定的實驗方法釐清納布芬在體內的代謝途徑，體外試驗使用單一純化的一相及二相cDNA表現酵素以及人肝微粒體酶進行酵素動力學研究，並依據細胞色素P450及尿苷二磷酸葡萄醣醛酸轉化酶在人體腸道及肝臟的表現量，選擇CYP1A2、CYP2C8、CYP2C9、CYP2C19、CYP2D6、CYP2E1、CYP3A4、CYP3A5以及UGT1A1、UGT1A3、UGT1A4、UGT1A6、UGT1A9、UGT1A10、UGT2B4、UGT2B7、UGT2B15、UGT2B17等18種在一般藥物具有高代謝比例的單一純化酵素進行試驗，透過Michaelis-Menten作圖以及Eadie-Hofstee的線性轉換進行判讀，並使用分析軟體GraphPad Prism Version 6.01依據不同動力學模型的非線性擬合求得各型酵素代謝納布芬的動力學參數。納布芬經由尿苷二磷酸葡萄醣醛酸轉化酶代謝的比例約占64-75%；而細胞色素P450則是25-36%。UGT2B7、UGT1A3與UGT1A9為主要負責納布芬葡萄醣醛酸化反應的代謝酵素，並且只有UGT2B7會生成納布芬-6-葡萄醣醛酸苷。CYP2C9與CYP2C19則是CYPs生成3′-羥基納布芬及4′-羥基納布芬的主要代謝酵素。經由人肝微粒體酶抑制試驗，計算出各型酵素於個別系統(CYPs或UGTs)中參與納布芬的代謝分率，並提出UGT2B7的整體代謝分率(fm, overall)與UGT1A3相當，且CYP2C9也佔有相當比例。動物實驗方面則發現，合併給予氟康唑後，相較於控制組，實驗組納布芬的Cmax上升12.4倍且AUCt上升13.2倍。實驗結果證實氟康唑有效阻斷納布芬在體內的代謝路徑，與體外代謝試驗所得結果一致，我們擬於未來透過相同的實驗方式去建立藥物代謝的雙系統平台，以期應用於臨床上藥物多系統代謝的研究。
李昀霈（2018）。柑橘黃單胞菌Xanthomonas axonopodis效應蛋白XopAI晶體結構與螢光光譜分析。﹝碩士論文。國立中興大學﹞臺灣博碩士論文知識加值系統。 https://hdl.handle.net/11296/sczsn8。
黃單孢菌（Xanthomonas axonopodis pv. Citri, Xac）是柑橘類植物潰瘍的主要致病原因，能利用第三型分泌系統（Type III secrestion system, T3SS）的複合蛋白質跨膜通道，將效應蛋白注入到宿主細胞中，影響宿主細胞的防禦機制，使細菌能有效感染宿主，因此，若能抑制效應蛋白作用或使效應蛋白攜帶藥物，將能降低柑橘潰瘍（Citrus canker）發生。Xac主要效應蛋白有四種，當中XopAI作用機制尚不明確。目前已知XopAI蛋白晶體堆疊方式，會將N端的Ser60、Arg62、Pro63、Leu64、Leu67與另一個XopAI分子的C端的凹槽處相互作用，其結果會影響到實際XopAI蛋白質分子與輔因子之間的結合，因此，在本實驗中我們為了瞭解它的作用機制，我們將它去除N端前70個胺基酸（XopAI-delN70）進行表現，並進行結晶體實驗解出其結構，與藉由螢光光譜分析法（Fluorescence spectroscopy）分析與輔因子之間關係。由實驗結果得知，當XopAI去除N端前70個胺基酸後，其蛋白質晶體結構空間群（Space group）為P21，具有四種蛋白質構型，其C端凹槽處為保留區，可能為它的活性區域，比對結果，其C端序列與HopU1、Vibrio splendidus的NAD+-Arg ADP-核醣基轉移酶（ADP- ribosyltransferase, ADP-RT）蛋白質為相似。在螢光光譜分析結果中，我們證實XopAI-delN70的Tryptophan於加入輔因子後螢光量會明顯下降，當中以NAD+影響程度最高，且再加入Arg還能提升兩者的作用，最後，利用GraphPad分析0.25 μM XopAI-delN70與NAD+的解離常數（Kd），計算結果Kd值介於955.8～1618 μM之間。
姚怡君（2017）。以農業廢棄物浸液抑制小球藻增生之效益研究。﹝碩士論文。國立臺灣大學﹞臺灣博碩士論文知識加值系統。 https://hdl.handle.net/11296/p7uq4p。
我國農林廢棄物因產源分散、缺乏集中收集及回收處理機制不完善，一般多在產地直接堆置、堆肥或焚燒等，為解決農林廢棄物回收管道不足及分解性剩餘資材過剩之問題，選用大葉欖仁落葉、稻篙與茶渣等3種台灣常見的農林生質廢棄物為材料，經紫外線（UV-C 237.5 nm）消毒殺菌、熱風乾燥並剪碎（φ≦10mm），以純水進行不同條件之浸製，每次試驗內容僅涉單因數變量；浸泡後以孔徑4um之定量濾紙過濾浸液，批次培養小球藻（Chlorella vulgaris）連續進行96hr，並記錄小球藻濃度、 pH值 及 EC值，利用 GraphPad Prism 及 SPSS 求得回歸方程式、半致死濃度（LC50）。
試驗結果分析得知，大部分農業廢棄物浸液對小球藻增生具有抑制作用。為評估農業廢棄物固體量是否有效降低抑制量，由殘體乾重，換算求得每日降解率，最小為 0.3152 (± 0.08) % ． day-1、最大為 2.0712 ± 0.08 % ． day-1 。
三種農業廢棄物在浸泡過程中，皆對抑制小球藻生長有程度上的影響。其影響效益取決於浸製條件。研究得知，大葉欖仁落葉浸液多數具抑藻效率，平均抑藻率為 33.5 % ，佔全部有抑藻作用組數之 41.5 % ；其次為茶渣浸液，平均抑藻率為 1.9 % ，占全部有抑藻作用組數之 30.8 % ；稻蒿浸液對小球藻生長抑制影響不大，平均抑藻率為 – 47.5 % ，占全部有抑藻作用組別之 27.7 % 。浸泡比例2.017 (± 0.043) × 10-3 g．mL-1，浸泡溫度 15 ± 0.9 ℃，浸泡時間 21.67 ± 1.39 日之浸液對小球藻生長抑制影響最大，此時 EC 差值 4750.22 ± 101.94 μS．cm-1 ， pH 差值 3.01 ± 0.14 。
水蚤毒性試驗之目的是為了篩選目的物種之安全性測試，由劑量-反應模式推估，水蚤半數致死濃度 LC50 約發生在 pH 5.713 ，以概率單位法 Probit 擬合毒性迴歸線 LC-p line，求出 IC50 約 51416 mol．mL-1 ， LogicLC50 約 4.71 mol．mL-1 ， 95% 可信賴區間為 20533 ~ 128624 mol．mL-1。顯示將植物浸液視為天然、低毒性之抑藻劑，是一種可行的方向。
朱佑祥（2012）。飲水過後所造成的滲透壓力反應對於紅血球細胞膜上水 通道蛋白1 的酪胺酸磷酸化程度與其調節。﹝碩士論文。國防醫學院﹞臺灣博碩士論文知識加值系統。 https://hdl.handle.net/11296/dq96ry。
實驗背景：
飲水在過去的研究中指出可以調節心血管的功能，雖然目前機轉不明。飲水在老年人和自主神經失調的病人中，可以藉著促進交感神經活性使血壓上升，這種現象在健康成年人身上也可以觀察到，但反應的強度較小。
實驗動機：
本計劃希望藉由人體飲水試驗，透過生理儀器監控受測者飲水前後生理數值變化，並搭配不同時間點血液內滲透壓變化去了解紅血球細胞膜上水通道蛋白1磷酸化程度。
實驗方法：
共有22位健康受試者(年齡25.3±3.03歲、身高約165.1±8.4公分、體重約60.5±8.4公斤、身體質量指數 (body mass index, BMI) 約22.1±1.8)。受試者依亂數表隨機分配2組實驗的先後順序：(1) 飲水50 ml；(2) 飲水 50 ml。若受試者人有近昏厥症狀時(presyncope)則結束實驗。利用finger volume clamp (Finapres blood pressure monitor, model 2300, Ohmeda, Madison, WI, USA)來記錄心跳速率、血壓、心搏量、心輸出量、周邊血管阻力及用(DRT4 laser-Doppler perfusion and temperature monitor, Moor Instruments Inc., Wilmington, DE, USA)偵測皮下血流速度的情形。並且在飲水前以及飲水後25和50分鐘分別收集受測者血液進行紅血球細胞膜上水通道蛋白磷酸化程度分析。
統計分析：
文中的統計與作圖是以Graphpad Prism 5軟體進行分析。使用Student’s T test用於比較兩組之間的差異。分別比較飲水50 ml和500 ml的情況下，飲水對生理功能的影響以及在飲水50 ml和500 ml時，其滲透壓變化對於紅血球膜蛋白AQP1功能性所造成的影響。圖中的數值以平均值±SD或平均值±SEM表示，p values < 0.05表示有統計上的差異。
實驗結果：
在飲水500 ml會造成收縮壓上升(P=0.006)、舒張壓上升(P=0.002)和周邊血管總阻力上升(P=0.001)、心輸出量下降(P=0.01)。飲水500 ml會使血液內滲透壓有明顯下降的趨勢，並且造成紅血球細胞膜上水通道蛋白1的酪胺酸磷酸化程度明顯上升。
結論：
本研究發現了飲水500ml的收縮壓有明顯的上升，周邊總阻力也有上升的情況，可能和交感神經活性上升有關。在飲水500ml的情況下所造成的血液滲透壓下降，此下降的環境會促使紅血球細胞膜上水通道蛋白1(Aquaporin-1)酪胺酸磷酸化程度上升而進行調節。
呂佳璘（2009）。飲水對年輕成人在傾斜床測試時對心率變異及血壓變異的影響。﹝碩士論文。國防醫學院﹞臺灣博碩士論文知識加值系統。 https://hdl.handle.net/11296/zpz46c。
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中文摘要 實驗背景： 實驗動機： 實驗方法： 統計分析： 實驗結果： 結論： |
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1. GraphPad Prism 的「護城河」
GraphPad Prism（由 GraphPad Software 開發，現隸屬於全球知名科學軟體集團 Dotmatics）是全球生物醫學、生命科學、藥理學以及神經科學領域中，市佔率最高、最受歡迎的科學實驗統計與繪圖軟體。
在科研界，兩大統計巨頭分別是 $ ext{LaTeX}$ 風格的程式碼流派（如 R 語言、Python）以及傳統的大型統計軟體（如 SAS、SPSS）。而 GraphPad Prism 則成功在兩者之間開闢了一條黃金航道：專為「不擅長寫程式、但對統計圖表有極高要求」的生物醫學科學家設計。
以下為您詳細拆解 GraphPad Prism 的商業護城河、符合的國際規範以及核心技術特點：
儘管市場上有許多免費的開源繪圖工具，但 Prism 的商業護城河極其深厚，主要體現在以下三個維度：
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全球生物醫學界「SCI 期刊發表的標準語彙」（The Publication Standard）：
這是 Prism 最強大的護城河。全球發表在 Nature、Science、Cell 等頂尖期刊上的生醫論文，其內文的柱狀圖、生存曲線圖（Kaplan-Meier curve）、劑量反應曲線，高達七成以上都是用 Prism 繪製的。期刊審查委員（Reviewers）對 Prism 的圖表風格和統計報告格式有著極高的熟悉度與信任度。對於趕著發表論文的教授與博士生來說，「使用 Prism = 降低圖表被審查委員刁難的風險」，這種心理黏著度建立了巨大的壁壘。
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無可取代的「統計引導與防呆機制」（Software with a Brain）：
傳統統計軟體（如 SPSS）只給使用者一個空白表格和幾百種統計選項，生醫背景的科學家常常會選錯統計方法（例如該用配對 t 檢定卻選成獨立 t 檢定）。Prism 內建了強大的「統計精靈與防呆功能」，它會用人類聽得懂的語言引導使用者填寫實驗設計，自動剔除不合理的統計選項。這種貼心的知識壁壘，讓非統計專業的科學家一用就離不開。
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Dotmatics 科研生態圈的協同效應：
GraphPad 加入 Dotmatics 集團後，與旗下的電子實驗記錄本（ELN）、SnapGene（分子生物學軟體）、Geneious 等生醫主流軟體進行了深度整合，從實驗設計、序列分析、數據統計到圖表產出，形成了全套的科研工作流閉環，這讓競爭對手更難單點突破。
2. 符合哪些國際規範與行業標準？
身為全球醫藥研發（R&D）的核心工具，GraphPad Prism 的計算精準度與產出數據，必須滿足全球各大藥監局與學術組織的嚴格規範：
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FDA 21 CFR Part 11 合規支援（醫藥研發核心）：
在製藥廠和生技公司的實驗室中，數據的真實性與防篡改至關重要。Prism 配合特定管理工具，能夠支援美國食品藥物管理局（FDA）針對電子紀錄與電子簽章的 21 CFR Part 11 規範，提供完整的審計追蹤（Audit Trails）功能，記錄是誰在何時修改了數據與統計模型，這是新藥開發（IND）申請時的法定必備條件。
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符合各大頂尖學術期刊的數位影像規範：
國際主流期刊對投稿的圖表解析度（DPI）、色彩模式（RGB/CMYK）、字型嵌入有著嚴格的印刷要求。Prism 支持一鍵匯出符合 ICMJE（國際醫學期刊編輯委員會） 與各大出版社標準的超高解析度（高達 1200 DPI）TIFF、EPS、PDF 向量圖檔，確保圖表在印刷時絕不失真。
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嚴格的數學與統計學公式檢驗：
內建的非線性回歸、方差分析（ANOVA）等算法，完全符合國際統計學標準，其計算結果與 SAS、R 語言等權威統計工具保持完全一致，確保科研數據的嚴謹性。
3. GraphPad Prism 的核心技術特點
Prism 之所以被稱為生醫科學家的「必備神外掛」，是因為它在功能設計上精準解決了生醫實驗的痛點：
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數據與圖表的「實時連動」自動化（Live Graphs）：
在 Prism 中，原始數據、統計分析結果與最終圖表是完全綁定、實時同步的。當使用者修改了實驗表格中的某個數值，或者剔除了某個極端值（Outlier），後方已經畫好的統計圖、做好的 t 檢定報告、甚至是 $ ext{P}$ 值（$P ext{-value}$）顯著性標記（如 $*$, $* *$, $* * *$），全都會在千分之一秒內自動重新計算並更新。使用者不需重新跑統計、不需重新畫圖，極大提升了重複實驗時的效率。
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專為生醫優化的統計模組組合：
內建了生醫領域最核心、最常用的進階統計分析，且一鍵即可完成：
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非線性回歸與劑量反應曲線（Nonlinear Regression / EC50）： 藥理學必備，自動擬合曲線並計算出藥物的 $IC_{50}$ 或 $EC_{50}$ 值。
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生存分析（Survival Analysis）： 癌症與臨床研究必備，一鍵生成 Kaplan-Meier 生存曲線，並自動執行 Log-rank 檢定。
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離群值自動偵測（Outlier Detection）： 利用獨家的 ROUT 方法，自動幫科學家找出並標記實驗中因為操作失誤產生的異常數據。
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一鍵添加「顯著性標記」（One-Click Significance）：
在其他軟體中，要在柱狀圖上方畫一條橫線並加上 $*$ 號（代表 $P < 0.05$）通常需要手動繪製線條、打字，費時且不精準。Prism 內建智慧分析功能，做完 ANOVA 或 t 檢定後，點擊按鈕即可自動在圖表正確的位置加上符合學術規範的顯著性連線與星號。
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引導式的「統計結果解讀」（Analysis Checklists）：
當 Prism 幫你跑完複雜的多元方差分析後，它不僅會給出一堆 P 值表格，還會附帶一個「分析檢查清單（Analysis Checklist）」。它會用直白的文字反問使用者：「你的數據符合常態分佈嗎？」、「你有做重複觀測嗎？」，並告訴你這個統計結果該如何正確解讀，扮演了「虛擬統計顧問」的角色。
總結來說：
GraphPad Prism 的核心護城河在於它「將高深的生醫統計學，包裝成極度直覺且高顏值的視覺化工作流」。它不僅幫科學家省去了學習程式碼的時間，更在國際學術界和製藥產業中建立了一套「信任與合規的標準語言」，是生命科學研究鏈中不可或缺的生產力工具。
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一、 GraphPad Prism 如何協助 老師獲得最大利益？
GraphPad Prism 將統計學與科學繪圖高度整合。針對鍾老師的研究領域，以下是發揮其最大價值的四個方向：
1. 酵素與材料催化動力學分析 (Catalytic Kinetics)
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非線性迴歸擬合： 鍾老師在研究酵素模擬物時，需分析反應速率與底物濃度的關係。Prism 內建專業的 Michaelis-Menten 動力學模型，能自動計算 $V_{max}$ 與 $K_m$。
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模型比較功能： 利用 Prism 的 AIC (Akaike Information Criterion) 或 F-test 功能，老師可以科學地判斷實驗數據更符合哪一種催化機制（例如：競爭性抑制或非競爭性抑制）。
2. 多組材料性能與環境變數的統計檢定
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二元變異數分析 (2-way ANOVA)： 在開發「二氧化碳吸附材料」時，常需同時比較「不同溫度」與「不同壓力」對吸附量的影響。Prism 能快速分析交互作用，並自動生成顯著性標註（如 p < 0.05）。
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熱圖 (Heat Maps) 呈現： 針對多種觸媒配比與反應條件的篩選，Prism 的熱圖功能能直觀呈現性能分佈，協助老師從大量實驗數據中找出最佳配方。
3. 高品質學術圖表自動化 (Workflow Efficiency)
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圖表一致性 (Magic Tool)： 催化反應常有大量重複性實驗。Prism 的 Magic (Make Graphs Consistent) 工具能一鍵將所有實驗圖表的樣式（座標軸、字體、符號）統一起來，確保投稿至 JACS 或 Angew. Chem. 等頂尖期刊時具備極高的專業度。
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數據連結更新： 只要在數據表中修改數值，所有關聯的統計圖表與擬合曲線會同步更新，大幅降低人為修改錯誤的風險。
二、 根據 老師專長建議的 5 種相關軟體
考量鍾老師在合成化學、材料分析與永續能源的專業，以下五款軟體在功能上能與 Prism 互補：
| 軟體名稱 | 建議用途 | 推薦理由 |
| 1. ChemDraw Professional | 分子結構與反應式繪製 | 化學家的標配。除了繪圖，其內建的 Chem3D 可進行初步的分子力學模擬，協助老師設計酵素啟發材料的活性中心結構。 |
| 2. MestReNova (Mnova) | NMR/LC-MS 數據處理 | 針對材料合成過程中的產物鑑定。能高效處理多維核磁共振光譜，並可將積分數據直接匯出至 Prism 進行定量分析。 |
| 3. CrystalMaker / VESTA | 晶體與多孔材料視覺化 | 鍾老師研究涉及金屬有機框架或無機催化劑，這類軟體能建立精美的晶體結構模型，展現材料的孔徑與活性位點空間分佈。 |
| 5. Gaussian / ORCA | 量子化學計算 | 老師的研究涉及催化機制探索，透過密度泛函理論 (DFT) 計算反應路徑的過渡態能量，能從理論層面支持實驗觀察到的催化效率。 |
三、 總結與應用策略
鍾博文老師 可以建立如下的高效研究流程：
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設計與模擬： 使用 ChemDraw 設計分子，Gaussian 預測反應活性。
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實驗與鑑定： 使用 Mnova 處理核磁數據，VESTA 展示材料結構。
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統計與發表： 將數據整合至 GraphPad Prism，進行非線性擬合與多組別統計檢定，最後產出符合國際頂尖期刊規範的高解析度圖表。
這套組合能兼顧化學合成的精準度與數據分析的科學嚴謹性。
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How to Create and Customize High-Quality Graphs in GraphPad Prism – graphpad.com
The Art and Science of Data Visualization
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Basic01 Simple
Basic01
Basic02 XY1Y2
Basic03 Second Y Axis
Basic04 Log Axis
Basic05 XYsubgroup1 NA
Basic06 XYsubgroup2
Basic07 XY MeanSD1
Basic08 XY MeanSD2
Basic09 XY Date MeanSD/p>
Basic10 XY Date
Basic12 Replicate
Basic14 Times
